Хроники лаборатории: как мы молотый кофе считали софтом для анализа клеточных структур

Продолжаю кофейную тематику, которую я начал еще на geektimes: Здравствуйте, я Meklon и я кофеин-зависимый. Сегодня мы будем творить непотребства с софтом для биоинженерных задач — CellProfiler. Нормальные люди им считают клетки, плазмиды, экспрессию белка и прочие нужные вещи. Мы долбанутые, поэтому будем проводить гранулометрический анализ помола по микрофотографии, бить кофе статическим электричеством и думать, как прицепить к этому безобразию фен. Ну и конечно нам потребуется скотч для получения графена картины распределения частиц.

В целом, компьютерный анализ изображения — штука гибкая и может применяться в совершенно странных задачах. Заодно проверим, можно ли заменить турку колбой с магнитной мешалкой. В конце концов, главный принцип выживания в лаборатории — «Нет кофе — нет работы») Под катом очень много фотографий, но я постарался их ужать до приличных размеров.

Синтаксис Python: применение генераторов

Генераторы Python уже давно используются для решения всевозможных проблем связанных с итерациями и потоками данных. В этом уроке мы рассмотрим некоторые экзотические виды использования генераторов, таких как написание контекста менеджеры, функций обратного вызова (callbacks), устранение рекурсии, workers и много другого. Внимание - видео очень длинное, но ЖЖУТКО интересное

rootkernel - CERN's ROOT/C++ ядро для Jupyter

hacker-scripts - скрипты из истории http://bash.im/quote/436725

XlsXcessive - создаем .xlsx файлы

Raspberry Pi 2 + цветок == интересная задача

Статья описывает как воспользоваться датчиком влажности и получить с него данные через Интернет. 

neobunch - словарь с доступом через точку (как в JS)

>>> b = NeoBunch()
>>> b.hello = 'world'
>>> b.hello
'world'
>>> b['hello'] += "!"
>>> b.hello
'world!'
>>> b.foo = NeoBunch(lol=True)
>>> b.foo.lol
True
>>> b.foo is b['foo']
True

dinopy - утилиты для файлов формата FASTA и FASTQ

ButterflyNet – framework для работы с сетью на asyncio

Фреймворк был разработан чтобы упростить работу с сокетами (ибо они не так просты), Twisted сложная для обучения, да и в нем много мусора, а asyncio хорошо подходит для сетевых взаимодействий.

tornado-crontab - CronTab callback для Tornado

Конвертируем XLSX в PDF

По ссылке вы найдете готовый код для конвертирования XLSX в PDF

dukpy - интерпретатор JavaScript на Python

Интепретатор поддерживает CoffeeScript, EcmaScript6, EcmaScript5, чистый Javascript

>>> import dukpy
>>> dukpy.coffee_compile('''
...     fill = (container, liquid = "coffee") ->
...         "Filling the #{container} with #{liquid}..."
... ''')
'(function() {\n  var fill;\n\n  fill = function*(container, liquid) {\n    if (liquid == null) {\n      liquid = "coffee";\n    }\n    return "Filling the " + container + " with " + liquid + "...";\n  };\n\n}).call(this);\n'

django-pj-feedreader - Django/AngularJS RSS feed reader

JSON парсеры - производительность и потребление памяти

В статье вы найдете подробное сравнение JSON парсеров. Будут рассматрваться такие параметры как производительность и потребление памяти.

Список JSON библиотек:

cjson, rapidjson, yajl, ujson, jsonlib2, jsonlib, simplejson, json.

console_video - проигрываем видео в консоли (на основе ffmpeg)

jw.lognotify - оповещения в реальном времени на основе логгирования

imapy - IMAP для людей

HtmlPy – GUI библиотека на основе Qt, HTML, CSS

Flappy Bird в 87 строк на Python

django-array-tags - поле для хранения тегов

Поле реализовано на основе PostgreSQL и ArrayField